Descrição: Começou a carreira jogando pelo Fluminense, em 2005, e sofreu uma grave lesão em 2006. Foi se tratar no centro médico do São Paulo Futebol Clube, e acabou por ser contratado pelo mesmo no ínicio de 2007. Mostrando já estar totalmente recuperado, o jovem volante teve poucas chances de atuar no Tricolor Paulista, e acabou sendo dispensado no fim da temporada, após o título de campeão brasileiro.
Foi contratado pela Goiás, para a disputa da temporada de 2008, e acabou não se firmando no clube esmeraldino. No início de 2009 foi emprestado à Portuguesa, onde não teve muito destaque. Acabou retornando ao Goiás ao final do empréstimo, se tornando titular durante toda a campanha do time goiano no Campeonato Brasileiro. Em dezembro de 2009, Fernando não aceitou a proposta de renovação de contrato e deixou o clube de Goiania. Acabou sendo contratado pelo Flamengo para a temporada de 2010, para suprir a saída de Aírton.
Após ser titular em alguns jogos do Estadual e se destacar, o volante foi perdendo espaço no elenco ao longo do ano, e foi reserva durante quase todo Campeonato Brasileiro. Mas ainda assim recebeu um voto de confiança da diretoria e permaneceu no clube para a temporada 2011. Mais uma vez começou o Carioca como titular, mas aos poucos foi perdendo espaço no elenco e fez sua última partida pelo Flamengo no início do Brasileiro, ficando vários meses encostado até o final do seu contrato em dezembro.